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大腸 肛門科疾患のポータルサイト：大腸・COM（http://daichou.com)
大腸癌の遺伝子分類
基本的な話
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DNAは細胞の最も基本となる設計図です。 この設計図を元にして「実際の製造の指示書（RNA）」が作られます 「遺伝子で分類」と言っても、DNAで分類するのか、RNAで分類するのかで違います。 解り易い例で言うと 日本に生まれた一卵性双生児のA君とB君がいたとします・・・ A君はアフリカへ里子に出されました。皮膚は黒くなり暑さに順応しました。 B君は北極へ里子に出されました。体毛は濃くなり寒さに順応しました。 この場合 A君もB君もDNAは全く、同一で「日本人型」ですが RNAはA君は「アフリカ人型」、B君は「エスキモー型」になっています。 厳密に言うと・・・・・A君とB君のDNAは環境により僅かに違いができます（エピゲノム） しかし、この違いを検出するのは技術的に難しいため、二人の違いは 「DNAでは検出されない。RNAで検出される」ことになります。 |
大腸癌のDNA解析
このサイトでも以前、ご紹介しましたが（「大腸癌の全遺伝子解読」）ここ数年、複数のグループの競争の末、総計３００名の大腸癌の全遺伝子が解読され、DNAレベルでの分類がおこなわれました。
それは以下のように二つのグループに分けるというものです〔文献）。
| DNAの安定性 | 変異している代表的遺伝子 | 臨床的特長 | |
| hypermutated | DNAの点変異を修復する機能欠損が多く 点変異レベルでの異常が蓄積する microsatellite instability (MSI), with hypermethylation |
hypermethylation and MLH1 silencing, BRAF V600E mutations ACVR2A, APC, TGFBR2, MSH3, MSH6, SLC9A9 and TCF7L2 |
右側に多い 比較的予後が良い 遺伝性大腸癌（HNPCC)はこのタイプ。 |
| non-hypermutated | 染色体の分離を司る機能の障害が多く 染色体レベルでの組み換えが蓄積し、 「融合遺伝子」が大量に作られる microsatellite-stable but chromosomally unstable |
APC, TP53, SMAD4, PIK3CA and KRAS ARID1A, SOX9, and FAM123B/WTX. FBXW7,TCF7L2 and NRAS amplifications of ERBB2 、IGF2 fusion of NAV2 andTCF7L1. |
左に多い 腺腫から癌化する、最も一般的な大腸癌 |
英語の遺伝子名の羅列は「ご愛嬌」です。
重要なことは・・・・
今までは「APCの変異した大腸癌」とか「MLH１の変異した大腸癌」などというように「個々の遺伝子異常の次元」で語られていた「大腸の癌化」が、より包括的な視点で整理されたということです。
つまり・・・・・大腸癌は二つのグループ（DNAの点変異を修復する機能が欠損した癌と、染色体の分離を司る機能の障害した癌と）に分けられ整理されたという訳です。
「大腸癌が二つのグループに分けられる」というのは随分前から臨床的に言われていたことで、DNAの解析でそれが「裏付けられた」という訳です
そして今回・・・・・、この研究では「大腸癌のRNAを解析してグループ分け」を試みました。
すると・・・・３つのグループに分けられました
グループ１・・・・「DNA分類のnon-hypermutated」に相当
グループ２・・・・「DNA分類のhypermutated」に相当
DNAが違えば、RNAも違うので、ここまでは想定内の話・・・・
ところが
第３のグループが同定された訳です。
この第３のグループは「microsatellite ,hypermethylation,BRAF、KRAS」などの変異が「あるものもあれば、無いものもあり。DNAレベルでは統一的な特徴は記述できない」ということも解りました。
そして「非常に予後が悪い」「過形成ポリープと深い関係がある」「右にも左にも同率で発生」などが解ったということです。
このような高度な研究が発表される前から、臨床的に「第３のグループがあるのではないか？（Serrated Pathway）」という推測はありましたが、遺伝子レベルでの裏づけがありませんでした。
「DNA解析では認識されなかった「第３のグループ」が、RNA解析で同定され、以前からの臨床的な分類と符号した」という訳です。
どうして、DNA解析とRNA解析で食い違いが生じたのか？
おそらく、上記のA君とB君の話と同じようなことなのでしょうが、その詳細は現時点では不明です。
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